Pada program studi ekonomi syariah, terdapat empat klasifikasi mata kuliah, yaitu: Mata Kuliah Wajib Negara (MKWN), Mata Kuliah Penciri Universitas, Mata Kuliah Inti Program Studi, Mata Kuliah Pilihan, dan Mata Kuliah Penunjang. Adapun pembagian mata kuliah secara lebih rinci adalah sebagai berikut;
Mata Kuliah Wajib Negara: Pendidikan Kewarganegaraan, Pancasila, Bahasa Indonesia.
Mata Kuliah Penciri Universitas: Kemuhammadiyahan.
Mata Kuliah Inti Program Studi, Meliputi:
- Bidang Ilmu Agama Islam: Ilmu al-Qur’an dan Hadist, Ushul Fiqh, Fiqh Muamalah Iqtishadiyah, Qawaid Fiqhiyyah, Ayat dan Hadist Ekonomi, Hukum Ekonomi Syariah, Fiqh Ibadah, Sejarah Pemikiran Ekonomi Islam, Industri dan Produk Halal.
- Bidang Ilmu Ekonomi: Matematika Ekonomi, Pengantar Ilmu Ekonomi, Pengantar Bisnis, Teori Ekonomi Makro, Teori Ekonomi Mikro, Ekonomi Moneter, Ekonomi dan Keuangan Internasional, Ekonomi Pembangunan Islam, Ekonomi ZISWAF, Politik Ekonomi Islam, Kewirausahaan, Pengantar Bisnis, Etika Bisnis, Lembaga Keuangan Syariah.
- Bidang Ilmu Manajemen: Pengantar Manajemen, Manajemen Keuangan, Manajemen Pemasaran Manajemen Dana Bank Syariah, atematika Ekonomi, Pengantar Ilmu Ekonomi, Pengantar Bisnis, Teori Ekonomi Makro, Teori Ekonomi Mikro, Ekonomi Moneter, Ekonomi dan Keuangan Internasional, Ekonometrika Islam, Ekonomi Pembangunan Islam, Ekonomi ZISWAF, Politik Ekonomi Islam.
- Bidang Ilmu Akuntansi: Pengantar Akuntansi, Teori Akuntansi Syariah.
Mata Kuliah Pilihan: Akuntansi Perbankan, Pasar Modal Syariah, Perbankan Syariah, Akuntansi Syariah, Akuntansi Keuangan, Sistem Informasi Akuntansi, Sistem Informasi Manajemen, Manajemen SDM Islami, Manajemen Pemasaran Syariah, Manajemen Dana Bank Syariah, Pembiayaan Mikro Syariah, Fintech Syariah, Studi Kelayakan Pembiayaan, Perpajakan, Akuntansi Nirlaba, Analisis Laporan Keuangan, Teori Akuntansi Syariah, Manajemen Strategik, Perencanaan Keuangan Syariah, Studi Kelayakan Bisnis, Perilaku Keorganisasian.
Mata Kuliah Penunjang: Qiraah, Kitabah, Productive Skills of FSLP, English Proficiency TPC, Ilmu Sosial Budaya Dasar, Statistik Deskriptif, Ekonometrika, Statistik Deskriptif, Statistik Induktif, Aplikasi Komputer dan Bisnis, Metode Penelitian, Seminar Penelitian, PKN, PMM, SLT, Skripsi/Tugas Akhir.
